RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.55■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.55■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.55■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.55■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ANKRD62A6NC57 917 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SPOPO43791 374 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ECE2O60344 883 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CALCOCO2Q13137 446 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CGB2Q6NT52 195 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TPH2Q8IWU9 490 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 KAT5Q92993 513 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 AGPAT1Q99943 283 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CLDN3O15551 220 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 GRIK3Q13003 919 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.54■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 H0YIN7 160 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 EML1O00423 815 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 FAM13AO94988 1023 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CETPP11597 493 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ALADP13716 330 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 DLG4P78352 724 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SLMAPQ14BN4 828 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SPOCK2Q92563 424 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TISP43B9A030 160 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 FAM86B1E9PN63 330 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SPAG7O75391 227 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGAP4P98171 946 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ART4Q93070 314 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SAAL1Q96ER3 474 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 BATF3Q9NR55 127 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 AAASQ9NRG9 546 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PODXLO00592 558 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CALCAP01258 141 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 BORCS6Q96GS4 357 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 IFT74Q96LB3 600 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 HAO1Q9UJM8 370 aa16.53■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CTNNA2P26232 953 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 NT5C2P49902 561 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 MYL7Q01449 175 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 KRT17Q04695 432 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 PPP2R5EQ16537 467 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 ERMNQ8TAM6 284 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 SYT11Q9BT88 431 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.52■□□□□ 0.24
SFRP4-201ENST00000436072 CHRNB2P17787 502 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF131P52739 623 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 VSIG1Q86XK7 387 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 PASKQ96RG2 1323 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 LTBP1Q14766 1721 aa16.52■□□□□ 0.23
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms