RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379299.6

TMEM230-208, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best)

Gene TMEM230, Length 1,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-208ENST00000379299 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 OGFRQ9NZT2 677 aa20.41■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 A0A0U1RQJ8 604 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 NBNO60934 754 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 CHRNA1P02708 482 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 ACRP10323 421 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 RARRES1P49788 294 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 CLCN3P51790 818 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 MGAT3Q09327 533 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 MBTPS1Q14703 1052 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 GPNMBQ14956 572 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 ARSHQ5FYA8 562 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 TMEM240Q5SV17 173 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 SLC35F6Q8N357 371 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 CEP112Q8N8E3 955 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 VWCEQ96DN2 955 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 DGAT1O75907 488 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 FGBP02675 491 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 KLK7P49862 253 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 ZNF365Q70YC5 407 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 TDHQ8IZJ6 230 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 GOLGA1Q92805 767 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 AKT3Q9Y243 479 aa20.39■□□□□ 0.86
TMEM230-208ENST00000379299 EVPLQ92817 2033 aa20.39■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 EYA4O95677 639 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 CDC42EP1Q00587 391 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 GIT2Q14161 759 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 RABGGTAQ92696 567 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SQORQ9Y6N5 450 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SCN5AQ14524 2016 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 ACTN1P12814 892 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SHHQ15465 462 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 USP38Q8NB14 1042 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TCP11Q8WWU5 503 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 VTNP04004 478 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 EMC2Q15006 297 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 HERVK_113Q902F9 699 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.37■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 ARID2Q68CP9 1835 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 KRT86O43790 486 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 DRP2Q13474 957 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 KIAA1328Q86T90 577 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 NEK11Q8NG66 645 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SEPT8Q92599 483 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 CETN3O15182 167 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 GPR32O75388 356 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 GHRP10912 638 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 GAP43P17677 238 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 LPIN1Q14693 890 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 KIZQ2M2Z5 673 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 CCDC42Q96M95 316 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-208ENST00000379299 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms