RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CAPN9O14815 690 aa23.26■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 KRT36O76013 467 aa23.26■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 SOX5P35711 763 aa23.26■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 CDR2Q01850 454 aa23.26■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 AP1B1Q10567 949 aa23.26■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.25■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 SLC35C1Q96A29 364 aa23.25■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 USP17L4A6NCW7 530 aa23.25■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 KBTBD2Q8IY47 623 aa23.24■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 KRT82Q9NSB4 513 aa23.24■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.23■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.23■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 CCDC125Q86Z20 511 aa23.23■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.23■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.23■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.23■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 STK33Q9BYT3 514 aa23.22■■□□□ 1.31
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OPN3-201ENST00000366554 RASA4O43374 803 aa23.21■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 THAP12O43422 761 aa23.21■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 USP17L8P0C7I0 530 aa23.21■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 GPBP1Q86WP2 473 aa23.21■■□□□ 1.31
OPN3-201ENST00000366554 MAML1Q92585 1016 aa23.21■■□□□ 1.31
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