RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573850.1

KIAA0556-209, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 5

Gene KIAA0556, Length 3,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-209ENST00000573850 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.96□□□□□ -0.49
KIAA0556-209ENST00000573850 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.96□□□□□ -0.49
KIAA0556-209ENST00000573850 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 LRRD1A4D1F6 860 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CCND1P24385 295 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 MSH2P43246 934 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 BIRC3Q13489 604 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TNFAIP1Q13829 316 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 USP38Q8NB14 1042 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 UCMAQ8WVF2 138 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 AZI2Q9H6S1 392 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 EML1O00423 815 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TRAF5O00463 557 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CIITAP33076 1130 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SLC12A3P55017 1021 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SESN3P58005 492 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 WDR18Q9BV38 432 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 HACL1Q9UJ83 578 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SMAPO00193 183 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CYP3A4P08684 503 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PAEPP09466 180 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 RPA1P27694 616 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ARSHQ5FYA8 562 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SPATA21Q7Z572 469 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 MFN1Q8IWA4 741 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 LRRC45Q96CN5 670 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TRIM4Q9C037 500 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.95□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 F8VZ95 297 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TNNC1P63316 161 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 LRRC63Q05C16 580 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ADCY1Q08828 1119 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 HHATQ5VTY9 493 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TPH2Q8IWU9 490 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TEPSINQ96N21 525 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 VAV3Q9UKW4 847 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 FZD1Q9UP38 647 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 RAD23BP54727 409 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 VWA3BQ502W6 1294 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCB11O95342 1321 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ALAS1P13196 640 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ALADP13716 330 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CFAP73A6NFT4 308 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 FAM163BP0C2L3 166 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 CREB1P16220 341 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 MAP3K10Q02779 954 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 P3H4Q92791 437 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 DYDC2Q96IM9 177 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 TMEM237Q96Q45 408 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 NR2E1Q9Y466 385 aa11.93□□□□□ -0.5
KIAA0556-209ENST00000573850 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 176.7 ms