RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC11A1	P49279	550 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ZP2	Q05996	745 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	TMC7	Q7Z402	723 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	URGCP	Q8TCY9	931 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM169	Q96HH4	297 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	GBP3	Q9H0R5	595 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBP1	Q9H171	429 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL5C	A6NH57	179 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	POMC	P01189	267 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	NAMPT	P43490	491 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT79	Q5XKE5	535 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	GAD1	Q99259	594 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	24.09	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	24.08	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200		E9PMD0	336 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK18	Q7Z418	384 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS52	Q8N1B4	723 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	POLD4	Q9HCU8	107 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DNM3	Q9UQ16	869 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	IRAK3	Q9Y616	596 aa		24.08	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EDN1	P05305	212 aa		24.07	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MLH1	P40692	756 aa		24.07	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KIFAP3	Q92845	792 aa		24.07	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP42	Q96MM3	310 aa		24.07	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MIOS	Q9NXC5	875 aa		24.07	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		24.07	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NPTXR	O95502	500 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH2	P05091	517 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSA	P10619	480 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DSC1	Q08554	894 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R5A	Q15172	486 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HYI	Q5T013	277 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	24.06	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ACKR2	O00590	384 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NRP1	O14786	923 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK6	Q16659	721 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DAW1	Q8N136	415 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	24.05	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL14	O95715	111 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EFEMP2	O95967	443 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCB	P05771	671 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP5	P24588	427 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SCNN1G	P51170	649 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HACE1	Q8IYU2	909 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SUSD6	Q92537	303 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMA5	Q96PV4	448 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	APOL6	Q9BWW8	343 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	S1PR5	Q9H228	398 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH5	Q9NX47	278 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	USP20	Q9Y2K6	914 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		24.04	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EFNA5	P52803	228 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK7	Q13164	816 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	BRAP	Q7Z569	592 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT74	Q96LB3	600 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	STK39	Q9UEW8	545 aa		24.03	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		24.02	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GIT2	Q14161	759 aa		24.02	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	24.02	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN14	Q15678	1187 aa		24.02	■■□□□ 1.44
PPP4C-205	ENST00000563200	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		24.02	■■□□□ 1.44

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