RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-223ENST00000551137 TRIOO75962 3097 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 C2orf71A6NGG8 1288 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ARL5CA6NH57 179 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 LRRIQ4A6NIV6 560 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 HIDE1A8MVS5 230 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ACKR2O00590 384 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PER2O15055 1255 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 B4GALT3O60512 393 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 DDHD2O94830 711 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 EFEMP2O95967 443 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ALDH2P05091 517 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 SLC11A1P49279 550 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NDUFV1P49821 464 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 DSC1Q08554 894 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 MAPK6Q16659 721 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 LONRF3Q496Y0 759 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 BRAPQ7Z569 592 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 HACE1Q8IYU2 909 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 VPS52Q8N1B4 723 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CPB2Q96IY4 423 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ZBP1Q9H171 429 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 RNF39Q9H2S5 420 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 C17orf75Q9HAS0 396 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PI4K2BG5E9Z4 385 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 B4GALT5O43286 388 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 BMP15O95972 392 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 SRGAP2BP0DMP2 458 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CTSAP10619 480 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PDCP20941 246 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PLPP4Q5VZY2 271 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 MAEAQ7L5Y9 396 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 COLGALT2Q8IYK4 626 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 GSTCDQ8NEC7 633 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 SUSD6Q92537 303 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 IFT74Q96LB3 600 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 AK8Q96MA6 479 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 GAD1Q99259 594 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 TIPINQ9BVW5 301 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PP2D1A8MPX8 630 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 E9PMD0 336 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 N4BP3O15049 544 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 LILRB3O75022 631 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CSPG5O95196 566 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CXCL14O95715 111 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 POMCP01189 267 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 GUCY2CP25092 1073 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CDC25AP30304 524 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 GPR65Q8IYL9 337 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 DAW1Q8N136 415 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 DEPTORQ8TB45 409 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 KCNN1Q92952 543 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ZFP42Q96MM3 310 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 S1PR5Q9H228 398 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 KCND2Q9NZV8 630 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 KCNG1Q9UIX4 513 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 HES2Q9Y543 173 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NRP1O14786 923 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 NPTXRO95502 500 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 C1RP00736 705 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 PRKCBP05771 671 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 MLH1P40692 756 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 MAPK7Q13164 816 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CLUL1Q15846 466 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 ANKRD54Q6NXT1 300 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 SYCE2Q6PIF2 218 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 KCNK18Q7Z418 384 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 CASP10Q92851 521 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-223ENST00000551137 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms