RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 NINJ1Q92982 152 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 TOR3AQ9H497 397 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PR48 441 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 PRSS38A1L453 326 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 SCNN1BP51168 640 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 PPARAQ07869 468 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 APPBP2Q92624 585 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 FAM189BP81408 668 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 TAP1Q03518 808 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 TERF2Q15554 542 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 XYLT1Q86Y38 959 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 NIM1KQ8IY84 436 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 AHI1Q8N157 1196 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 UBXN4Q92575 508 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 COL4A3Q01955 1670 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 GAGE12BA1L429 117 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LCHNA4D1U4 455 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LSSP48449 732 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 IL2P60568 153 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 TKFCQ3LXA3 575 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 C11orf74Q86VG3 221 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SPON1Q9HCB6 807 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 FANCLQ9NW38 375 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PRSS50Q9UI38 385 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 TMEM200CA6NKL6 621 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 DIRC3C9JPN6 131 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 KDM1AO60341 852 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LPXNO60711 386 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF4O60810 478 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 FBLP22087 321 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PTTG1IPP53801 180 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 USP14P54578 494 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 MANFP55145 182 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 APBA1Q02410 837 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 UBE3CQ15386 1083 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 OR14C36Q8NHC7 312 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 DRC1Q96MC2 740 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SERHL2Q9H4I8 314 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 PIF1Q9H611 641 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 AKIP1Q9NQ31 210 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 CHST2Q9Y4C5 530 aa7□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ZAR1LA6NP61 321 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 B5MCH6 92 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 LEFTY2O00292 366 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 RAB11FIP3O75154 756 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 NCR1O76036 304 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 Q6YL49 198 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 VOPP1Q96AW1 172 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ANO3Q9BYT9 981 aa6.99□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 FKBP9O95302 570 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 MGAT1P26572 445 aa6.98□□□□□ -1.29
SGCE-211ENST00000522045 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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