RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 CCDC172P0C7W6 258 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ARP10275 920 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 GHRP10912 638 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 GCLMP48507 274 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 MCM8Q9UJA3 840 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 GAS7O60861 476 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 WLSQ5T9L3 541 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CD101Q93033 1021 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CEP57Q86XR8 500 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ASAP2O43150 1006 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RARAP10276 462 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ECE1P42892 770 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 GPC5P78333 572 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 LXNQ9BS40 222 aa20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 K7ENM7 598 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TP73O15350 636 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 MGRN1O60291 552 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 AGTP01019 485 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CREB1P16220 341 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 E2F5Q15329 346 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 EPC2Q52LR7 807 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC174Q6PII3 467 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 P3H4Q92791 437 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ART4Q93070 314 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 IDI2Q9BXS1 227 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SCN9AQ15858 1988 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLX4Q8IY92 1834 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 BCRP11274 1271 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ADCY2Q08462 1091 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC25Q86WR0 208 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 NACC1Q96RE7 527 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TCEAL1Q15170 157 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CNGA2Q16280 664 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 AAASQ9NRG9 546 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 GGT7Q9UJ14 662 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PFASO15067 1338 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 G3V3G9 751 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PODXLO00592 558 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 HSPA6P17066 643 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 VAMP7P51809 220 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 LRRC14Q15048 493 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CYP1B1Q16678 543 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RASGRF2O14827 1237 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 RTN2O75298 545 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 RFX1P22670 979 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ITIH4Q14624 930 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 LONRF1Q17RB8 773 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 NSMFQ6X4W1 530 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms