RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ANK1	P16157	1881 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ACKR2	O00590	384 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ABLIM1	O14639	778 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SLC16A4	O15374	487 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PPP1R37	O75864	691 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	FAM13A	O94988	1023 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CASP1	P29466	404 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	AXL	P30530	894 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	GATM	P50440	423 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	EHHADH	Q08426	723 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	DGKI	O75912	1065 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ERLIN2	O94905	339 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	EFNA5	P52803	228 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	COASY	Q13057	564 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	RAB30	Q15771	203 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538		A0A1B0GUA9	196 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538		K7ENM7	598 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	KLRC4	O43908	158 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ZNF623	O75123	536 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PIGR	P01833	764 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CA3	P07451	260 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	FGFR1	P11362	822 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	PROZ	P22891	400 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SYK	P43405	635 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	RAB27A	P51159	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CASP5	P51878	434 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	MAPK6	Q16659	721 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	RAD9A	Q99638	391 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	CIT	O14578	2027 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	N4BP3	O15049	544 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	INPPL1	O15357	1258 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TLL1	O43897	1013 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	TRAK2	O60296	914 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	UPP2	O95045	317 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP22-211	ENST00000584538	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32

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