RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP37Q86T82 979 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPD1LQ8N335 351 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMC1BQ8NDV3 1235 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 AFG1LQ8WV93 481 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 HHIPL1Q96JK4 782 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1586Q9HCI6 787 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIX2Q9NPC8 291 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 AIPL1Q9NZN9 384 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMPD1P17405 629 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFNA5P52803 228 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 APBA1Q02410 837 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBWD6Q4V339 395 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBWD3Q5JTY5 395 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBWD5Q5RIA9 395 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUGCTQ9HAC7 445 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 STYXL1Q9Y6J8 313 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 PMM2O15305 246 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPING1P05155 500 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLFN12LQ6IEE8 588 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPAG5Q96R06 1193 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEF6Q9H4E7 631 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LZTFL1Q9NQ48 299 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA8IPA6NC78 632 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA8JA6NMD2 632 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADRB2P07550 413 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAPGEF1Q13905 1077 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF662Q6ZS27 426 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBWD2Q8IUF1 395 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMC2Q8TDI7 906 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAAL1Q96ER3 474 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFSD14AQ96MC6 490 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TM4SF4P48230 202 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DLG4P78352 724 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPA17Q15506 151 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6J1Q8NGC5 347 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP6NLQ92738 828 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAI1Q9UI46 699 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FHOD1Q9Y613 1164 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL1A2P08123 1366 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DRP2Q13474 957 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 HGSNATQ68CP4 663 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYRIPQ8NFW9 859 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf40Q9H1Z8 148 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNPEPQ9H4A4 650 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 HAUS4Q9H6D7 363 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DOCK3Q8IZD9 2030 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASAP2O43150 1006 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF5CO60282 957 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCA5LO95447 670 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGS2P41220 211 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNG11P61952 73 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASIC2Q16515 512 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 EHBP1Q8NDI1 1231 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOCS4Q8WXH5 440 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXTL3O43909 919 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RFX1P22670 979 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF11P52732 1056 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFAIP2Q03169 654 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFDP1Q14186 410 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf220Q5T0J3 134 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC71Q8N4P6 559 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARD3BQ8TEW8 1205 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C16orf70Q9BSU1 422 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM88BA6NKF7 163 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEB2O15479 319 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKR1B10O60218 316 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LDHAP00338 332 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP3CAQ08209 521 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 OLFML2BQ68BL8 750 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHO2Q8TD55 490 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO1AQ9UBC5 1043 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP3P08254 477 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 INSRRP14616 1297 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GTF2H1P32780 548 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP25P42331 645 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP24A1Q07973 514 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRHR2Q13324 411 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DGKDQ16760 1214 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFCAB12Q6NXP0 572 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZPBP2Q6X784 338 aa31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms