RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 TMEM253P0C7T8 217 aa28.54■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 STAT1P42224 750 aa28.54■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 PPARDQ03181 441 aa28.54■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 DCAF12L1Q5VU92 463 aa28.54■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 REEP2Q9BRK0 252 aa28.54■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 MMP13P45452 471 aa28.53■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.53■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 ASAP2O43150 1006 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 PLS1Q14651 629 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 CLUL1Q15846 466 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC197Q8NCU1 140 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 SLC35G2Q8TBE7 412 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 MDM1Q8TC05 714 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 BORCS6Q96GS4 357 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 SYT11Q9BT88 431 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 PNMA2Q9UL42 364 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 CCT8L1PA6NM43 557 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 ADM5C9JUS6 153 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 EVI5O60447 810 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 STAT3P40763 770 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 DR1Q01658 176 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 KLRG1Q96E93 195 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 OSGEPQ9NPF4 335 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 DONSONQ9NYP3 566 aa28.52■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 RPA1P27694 616 aa28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 ELF1P32519 619 aa28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 GJB7Q6PEY0 223 aa28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 DNM3Q9UQ16 869 aa28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa28.51■■■□□ 2.16
PXDC1-202ENST00000380283 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 GSTA1P08263 222 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SLC8A1P32418 973 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SOX5P35711 763 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CASP4P49662 377 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ITIH4Q14624 930 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PIGWQ7Z7B1 504 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 NEK9Q8TD19 979 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ODF2LQ9ULJ1 636 aa28.51■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PMS2P54278 862 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PSMC6P62333 389 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC134Q9H6E4 229 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.157e-7■■□□□ 13.8
PXDC1-202ENST00000380283 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC169A6NNP5 214 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SHBGP04278 402 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CHN1P15882 459 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 BTNL9Q6UXG8 535 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ANKS4BQ8N8V4 417 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ERMNQ8TAM6 284 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ANO3Q9BYT9 981 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM31Q9BZY9 425 aa28.5■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 NF2P35240 595 aa28.49■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PRKG1Q13976 671 aa28.49■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 STK33Q9BYT3 514 aa28.49■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L15C9J2P7 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L11C9JVI0 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L18D6R9N7 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L22D6RA61 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L19D6RCP7 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L20D6RJB6 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 TBX3O15119 743 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L24Q0WX57 530 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CROCCP2Q86T23 111 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 UIMC1Q96RL1 719 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 STK24Q9Y6E0 443 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 MMEP08473 750 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 NFIL3Q16649 462 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ZDHHC24Q6UX98 284 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 GLYCTKQ8IVS8 523 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ERVK-5Q9HDB9 667 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SLC12A4Q9UP95 1085 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.48■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 STAT2P52630 851 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 MAPK7Q13164 816 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 QRICH1Q2TAL8 776 aa28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms