RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa24.39■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.39■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.39■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.39■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GSTA2P09210 222 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRAFP15056 766 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VSIG1Q86XK7 387 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIGSQ96S52 555 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GCNT4Q9P109 453 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP20Q9Y2K6 914 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GH1P01241 217 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMNAP02545 664 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYBL1P10243 752 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GJB7Q6PEY0 223 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC25Q86WR0 208 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF333Q96JL9 665 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.38■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 E9PMD0 336 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAC1P20366 129 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOX5P35711 763 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AADACL2Q6P093 401 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MXD3Q9BW11 206 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF220Q5VTB9 566 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO41Q8TF61 875 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PASKQ96RG2 1323 aa24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ECE2O60344 883 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP11B2P19099 503 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STRN3Q13033 797 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PARP10Q53GL7 1025 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCLRE1BQ9H816 532 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRCH1Q9Y2L9 728 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALG6Q9Y672 507 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADCY7P51828 1080 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CALCOCO2Q13137 446 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP1B1Q16678 543 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LONP2Q86WA8 852 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERP27Q96DN0 273 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYT11Q9BT88 431 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.36■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD62A6NC57 917 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDLIM1O00151 329 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAS1Q92839 578 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCOCQ9UIL1 159 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHKBQ9Y259 395 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDXKO00764 312 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCEA3O75764 348 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKAP3O75969 853 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACSL3O95573 720 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASA1P20936 1047 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUM1Q2TAK8 710 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC35C1Q96A29 364 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TLE6Q9H808 572 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAO1Q9UJM8 370 aa24.35■■□□□ 1.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COG5Q9UP83 839 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms