RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290178.4

PAXBP1-201, Transcript of PAX3 and PAX7 binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PAXBP1, Length 2,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1-201ENST00000290178 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 FAM83AQ86UY5 434 aa23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 ALG6Q9Y672 507 aa23.46■■□□□ 1.35
PAXBP1-201ENST00000290178 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MARCKSL1P49006 195 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 KDM7AQ6ZMT4 941 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SAAL1Q96ER3 474 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 EGFRP00533 1210 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SOX10P56693 466 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 KRT35Q92764 455 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 GLG1Q92896 1179 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.45■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CCNE2O96020 404 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MYBPC2Q14324 1141 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 RASA3Q14644 834 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 PSMD1Q99460 953 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 GTF2BQ00403 316 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CXCL9Q07325 125 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 PGM5Q15124 567 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.44■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 PSME4Q14997 1843 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 DPEP1P16444 411 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 ADSSP30520 456 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CORO7P57737 925 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 ZNF844Q08AG5 666 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CETN1Q12798 172 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 XKR9Q5GH70 373 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SEMA4DQ92854 862 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CCDC169A6NNP5 214 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 KCNA3P22001 575 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 LRRC45Q96CN5 670 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 WNK4Q96J92 1243 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 FAM84AQ96KN4 292 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CYP26A1O43174 497 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CLSTN1O94985 981 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CHRNB2P17787 502 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MXI1P50539 228 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 BTBD6Q96KE9 485 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MYO1FO00160 1098 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 EBAG9O00559 213 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 LSP1P33241 339 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 NSMFQ6X4W1 530 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CARD9Q9H257 536 aa23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MYZAPP0CAP1 466 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SEC24CP53992 1094 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MAP3K10Q02779 954 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 MESDQ14696 234 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 SEC14L1Q92503 715 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 RMDN3Q96TC7 470 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TMEM51Q9NW97 253 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 NDUFAB1O14561 156 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 VCAM1P19320 739 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 RFX1P22670 979 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 PTENP60484 403 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 NIM1KQ8IY84 436 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 STK32BQ9NY57 414 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 CALCAP01258 141 aa23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1-201ENST00000290178 DR1Q01658 176 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms