RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PBX2P40425 430 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.87■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 DAW1Q8N136 415 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PDILTQ8N807 584 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.87■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 RESP18Q5W5W9 173 aa20.86■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 REEP2Q9BRK0 252 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 INSL6Q9Y581 213 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 CITO14578 2027 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIP11Q15643 1979 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 AXLP30530 894 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 EFNA5P52803 228 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 ARSHQ5FYA8 562 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 YME1L1Q96TA2 773 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PANK2Q9BZ23 570 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 CUEDC2Q9H467 287 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 TSPAN1O60635 241 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.83■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 SKIP12755 728 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PLS3P13797 630 aa20.83■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 RAB27AP51159 221 aa20.83■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.83■□□□□ 0.93
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RABGGTA-208ENST00000558954 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0U1RQF3 1178 aa20.82■□□□□ 0.92
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RABGGTA-208ENST00000558954 AMHR2Q16671 573 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM187BQ17R55 369 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 TNMDQ9H2S6 317 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 PARVGQ9HBI0 331 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-208ENST00000558954 SFI1A8K8P3 1242 aa20.81■□□□□ 0.92
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