RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SEPT8	Q92599	483 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978		K7ENM7	598 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	TSPAN1	O60635	241 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PFKM	P08237	780 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF131	P52739	623 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	DEFB103A	P81534	67 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	COASY	Q13057	564 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	DACT1	Q9NYF0	836 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	GPR182	O15218	404 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	TRAK2	O60296	914 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ERLIN2	O94905	339 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PRKCB	P05771	671 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	MYB	P10242	640 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ACTN1	P12814	892 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	CASP5	P51878	434 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	CDC42EP1	Q00587	391 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	AMPD3	Q01432	767 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PNOC	Q13519	176 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	IKBKE	Q14164	716 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	AMHR2	Q16671	573 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	HERVK_113	Q902F9	699 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	APBB2	Q92870	758 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	FIZ1	Q96SL8	496 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ADAM2	Q99965	735 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	USP25	Q9UHP3	1055 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	GBF1	Q92538	1859 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ENPP3	O14638	875 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	KLRC4	O43908	158 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	UPP2	O95045	317 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	GAP43	P17677	238 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	KCNJ6	P48051	423 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	DPYD	Q12882	1025 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM25-208	ENST00000530978	DSC3	Q14574	896 aa		10	□□□□□ -0.81

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