RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.56□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 TOR3AQ9H497 397 aa6.56□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 SNTG2Q9NY99 539 aa6.56□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.56□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.55□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.55□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.55□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 WDR26Q9H7D7 661 aa6.55□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 B4E1Z4 1266 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 H7C1D1 291 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 MASP2O00187 686 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 MTSS1O43312 755 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 ADCY2Q08462 1091 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 ZNF174Q15697 407 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.54□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 UIMC1Q96RL1 719 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.54□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 A0A0A6YYJ9 748 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 TRIM24O15164 1050 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 LAG3P18627 525 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 CSRP2Q16527 193 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 MAN2A1Q16706 1144 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 MTG2Q9H4K7 406 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.53□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 ING3Q9NXR8 418 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLTC-208ENST00000496076 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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CLTC-208ENST00000496076 MAFGO15525 162 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 FSBPO95073 299 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 APOL3O95236 402 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 GYPEP15421 78 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 TAP1Q03518 808 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.52□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 EPC1Q9H2F5 836 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 CABP5Q9NP86 173 aa6.52□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 AHRRA9YTQ3 701 aa6.51□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 C21orf58P58505 322 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 ADCY1Q08828 1119 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.51□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 PLD2O14939 933 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 OPHN1O60890 802 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 GAAP10253 952 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 METTL24Q5JXM2 366 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 NRP1O14786 923 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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CLTC-208ENST00000496076 VPS72Q15906 364 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-208ENST00000496076 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.49□□□□□ -1.37
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