RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZEB2O60315 1214 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TPM3P06753 285 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 BSNDQ8WZ55 320 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM143Q96AN5 459 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC7Q9UPT5 735 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 HAS3O00219 553 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 C22orf31O95567 290 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 HS2ST1Q7LGA3 356 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 GBP3Q9H0R5 595 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC10BA6NIK2 292 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A4O15374 487 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ASAP2O43150 1006 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MSCO60682 206 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GLRA2P23416 452 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL13P26373 211 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC25BP30305 580 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX10P56693 466 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 UBASH3AP57075 661 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PPFIA1Q13136 1202 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TCP11X2Q5H9J9 407 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KAT2BQ92831 832 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NRCAMQ92823 1304 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ18B7U540 433 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GNA14O95837 355 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ12Q14500 433 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC55Q6ZSA7 311 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF2BP1Q8IU81 584 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM174Q8WUU8 243 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNKQ9P0W0 207 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL3P08590 195 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TMOD1P28289 359 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PURAQ00577 322 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD10Q14728 455 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIK4Q16099 956 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0753Q2KHM9 967 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 EFCAB12Q6NXP0 572 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCP3Q8IZU3 236 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SUGCTQ9HAC7 445 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM17Q9Y577 477 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CETN3O15182 167 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRC1P26715 233 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CST5P28325 142 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GRK4P32298 578 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PSEN2P49810 448 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 BEX3Q00994 111 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBPC2Q14324 1141 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GNASQ5JWF2 1037 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP4K3Q8IVH8 894 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ASAP3Q8TDY4 903 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX20Q9UMR3 447 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND3A2RUS2 1198 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFB1I1O43294 461 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNA1Q09470 495 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 FILIP1LQ4L180 1135 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS4O75173 837 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM9Q13443 819 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TFDP1Q14186 410 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MTHFD1LQ6UB35 978 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01465Q8N7H1 131 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DEPTORQ8TB45 409 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM134Q9H6X4 195 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NR2F2P24468 414 aa34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 IGBP1P78318 339 aa34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 POU5F1BQ06416 359 aa34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT31Q15323 416 aa34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf56Q8IXR9 622 aa34.07■■■■□ 3.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GTH6 734 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRIQ4A6NIV6 560 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 INHAP05111 366 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TPM2P07951 284 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 EFNA5P52803 228 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MARSP56192 900 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPSQ13938 189 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A9Q8IVB4 645 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC71Q8N4P6 559 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf40Q9H1Z8 148 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NR3C1P04150 777 aa34.06■■■■□ 3.04
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