RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASIC2Q16515 512 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPING1P05155 500 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX3P56589 373 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRADDQ15628 312 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD16Q68DU8 428 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NACC1Q96RE7 527 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MED4Q9NPJ6 270 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PXMP2Q9NR77 195 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCNT4Q9P109 453 aa16.89■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IVLP07476 585 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK7Q13164 816 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBWD6Q4V339 395 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR9Q5GH70 373 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT12Q99456 494 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUCY2DQ02846 1103 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHA7Q15375 998 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPAR1Q92633 364 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFU1Q9UMS0 254 aa16.88■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC169A6NNP5 214 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGPSO00116 658 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SATB1Q01826 763 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35C1Q96A29 364 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACP6Q9NPH0 428 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PON1P27169 355 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTK2Q05397 1052 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO41Q8TF61 875 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLRG1Q96E93 195 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAAL1Q96ER3 474 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUFT1Q9NNX1 390 aa16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC3O60645 756 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS20O76081 388 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFPT2O94808 682 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALCAP01258 141 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLI1P08151 1106 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR3C2P08235 984 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR78Q5VTH9 848 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF217Q8TC41 542 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTUD5Q96G74 571 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUFY1Q96T51 708 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELP3Q9H9T3 547 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STIM2Q9P246 746 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK3O14649 394 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RARRES1P49788 294 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIG3P49916 1009 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VGLL4Q14135 290 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP63Q96MT8 703 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF181Q9P0P0 153 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UCHL3P15374 230 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCP2P22307 547 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms