RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429270.1

BBX-210, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-210ENST00000429270 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 EP400Q96L91 3159 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 LTFP02788 710 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 RBP3P10745 1247 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PNLIPP16233 465 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ERVFC1P60507 584 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 NME9Q86XW9 330 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CMIPQ8IY22 773 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CPA6Q8N4T0 437 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 DLG3Q92796 817 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ACAP3Q96P50 834 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ZMAT4Q9H898 229 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 MSRAQ9UJ68 235 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 USP32Q8NFA0 1604 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 KLHL33A6NCF5 533 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 FOXP2O15409 715 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 SRGAP3O43295 1099 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 IL33O95760 270 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ADCY1Q08828 1119 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TPH2Q8IWU9 490 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 C7orf31Q8N865 590 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 MYLIPQ8WY64 445 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PALD1Q9ULE6 856 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 KIF1AQ12756 1690 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 DISP2A7MBM2 1401 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 LCHNA4D1U4 455 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TADA3O75528 432 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 MYL1P05976 194 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 VCAM1P19320 739 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 FNTBP49356 437 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 EPHA5P54756 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 GRIN1Q05586 938 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 LRP8Q14114 963 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 SEC23AQ15436 765 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TMEM240Q5SV17 173 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 Q8N3U1 123 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 HIPK4Q8NE63 616 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PEX11GQ96HA9 241 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CDK19Q9BWU1 502 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 LRP5O75197 1615 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PLSCR1O15162 318 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CYBBP04839 570 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TMEM253P0C7T8 217 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CYP2C19P33261 490 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 KRT85P78386 507 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 EPHA7Q15375 998 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 FERMT2Q96AC1 680 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 LRGUKQ96M69 825 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.28□□□□□ -1.24
BBX-210ENST00000429270 DLC1Q96QB1 1528 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 TRIM75PA6NK02 468 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 VSTM5A8MXK1 200 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 FZD9O00144 591 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 SGSM2O43147 1006 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 APOL3O95236 402 aa7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BBX-210ENST00000429270 DBHP09172 617 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms