RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 GJB6O95452 261 aa20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TNIP1Q15025 636 aa20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.39■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PRKCIP41743 596 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TNNI2P48788 182 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TTC27Q6P3X3 843 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 VSTM1Q6UX27 236 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 GPBP1Q86WP2 473 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PTGIRP43119 386 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 MARCKSL1P49006 195 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 LLGL1Q15334 1064 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SBK1Q52WX2 424 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CGB2Q6NT52 195 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CNBD1Q8NA66 436 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PFASO15067 1338 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 MPP2Q14168 576 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 FBF1Q8TES7 1133 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SYT15Q9BQS2 421 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TRIM7Q9C029 511 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 GCNT4Q9P109 453 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 LRRD1A4D1F6 860 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CCNG1P51959 295 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TEKT4Q8WW24 435 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SIX2Q9NPC8 291 aa20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 GNAZP19086 355 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 GBP1P32455 592 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 RPS6KA3P51812 740 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 RFFLQ8WZ73 363 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CARD9Q9H257 536 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 GM2AP17900 193 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 KCNJ1P48048 391 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 C12orf60Q5U649 245 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 KSR1Q8IVT5 923 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PRELID2Q8N945 189 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 KRT35Q92764 455 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 POTEB3A0JP26 581 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 POTECB2RU33 542 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CASP4P49662 377 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 NPEPPSP55786 919 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 EPHA7Q15375 998 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 POTEBQ6S5H4 581 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.36■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PHF2O75151 1096 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PEX11AO75192 247 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 UNC5CO95185 931 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PLA2G4BP0C869 781 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 FERP16591 822 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PPATQ06203 517 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 UBE2SQ16763 222 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 THAP2Q9H0W7 228 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 O00370 1275 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 VCAM1P19320 739 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 PDIA5Q14554 519 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 ARMC3Q5W041 872 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 TEX9Q8N6V9 391 aa20.35■□□□□ 0.85
PRPF39-201ENST00000355765 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms