RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TRIM7Q9C029 511 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ITGB4P16144 1822 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 DPPA5A6NC42 116 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 E7ENQ6 273 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 UNC5CO95185 931 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TMEM253P0C7T8 217 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 VCAM1P19320 739 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 EPHA7Q15375 998 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RNF43Q68DV7 783 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 VSTM1Q6UX27 236 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TMEM120BA0PK00 339 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TSPY3P0CV98 308 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TSPY8P0CW00 308 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CHRNA3P32297 505 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MGAT5Q09328 741 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 HYIQ5T013 277 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MFN1Q8IWA4 741 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 C18orf8Q96DM3 657 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PODXLO00592 558 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 HIP1RO75146 1068 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ARMC3Q5W041 872 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CGB2Q6NT52 195 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MGARPQ8TDB4 240 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 STX8Q9UNK0 236 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 NPTXRO95502 500 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ALAS1P13196 640 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 LMNB2Q03252 620 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ACVR2BQ13705 512 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PARP6Q2NL67 630 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ALG3Q92685 438 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PFASO15067 1338 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PEX11AO75192 247 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 NTSR2O95665 410 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 KRT13P13646 458 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 HSPA6P17066 643 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CALB2P22676 271 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PRELID2Q8N945 189 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TSC22D3Q99576 134 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CREB1P16220 341 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ATP6V1C1P21283 382 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 CTNNA2P26232 953 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 SMARCA1P28370 1054 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PRDX5P30044 214 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PARP10Q53GL7 1025 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 FBF1Q8TES7 1133 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ART4Q93070 314 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 NLRP3Q96P20 1036 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 PIGSQ96S52 555 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4-201ENST00000298317 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms