RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484313.3

ZEB2-222, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 2, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB2, Length 845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB2-222	ENST00000484313	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	MLEC	Q14165	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ZEB2-222	ENST00000484313	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	PTPRT	O14522	1441 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	NPAT	Q14207	1427 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZEB2-222	ENST00000484313	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	MIER1	Q8N108	512 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	A2M	P01023	1474 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ZEB2-222	ENST00000484313	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ZEB2-222	ENST00000484313	RGL2	O15211	777 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	POTEH	Q6S545	545 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	PZP	P20742	1482 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ZEB2-222	ENST00000484313	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	ABCC3	O15438	1527 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	TNR	Q92752	1358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	MED14	O60244	1454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	CPS1	P31327	1500 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	GGT6	Q6P531	493 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ZEB2-222	ENST00000484313	CEP152	O94986	1710 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ZEB2-222	ENST00000484313	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ZEB2-222	ENST00000484313	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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