RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-220	ENST00000618056	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	YME1L1	Q96TA2	773 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	PDC	P20941	246 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF410	Q86VK4	478 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	NLRP7	Q8WX94	980 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	SNX21	Q969T3	373 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	REV3L	O60673	3130 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	MGEA5	O60502	916 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	RPA1	P27694	616 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	PRPH	P41219	470 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	PDIA5	Q14554	519 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	SCLT1	Q96NL6	688 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	RGS18	Q9NS28	235 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056		A0A0C4DFX4	3053 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	MED24	O75448	989 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ERVK-21	P61565	698 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ADGRE1	Q14246	886 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	EMC2	Q15006	297 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	SPRED2	Q7Z698	418 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ADAM2	Q99965	735 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	CERS4	Q9HA82	394 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	MUT	P22033	750 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	RARRES1	P49788	294 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	TCP11	Q8WWU5	503 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
PMS1-220	ENST00000618056		A0A087WZ62	844 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	DENND3	A2RUS2	1198 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	EPOP	A6NHQ4	379 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	STAG3L1	P0CL83	205 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	DSC3	Q14574	896 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	BRAP	Q7Z569	592 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	DGAT1	O75907	488 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	DGKI	O75912	1065 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	TMEM143	Q96AN5	459 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	NACC1	Q96RE7	527 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	MTR	Q99707	1265 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056		C9IYK1	514 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	ASAP2	O43150	1006 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	SAMD11	Q96NU1	681 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	FAM189B	P81408	668 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	KSR1	Q8IVT5	923 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	NLRP4	Q96MN2	994 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	POTEG	Q6S5H5	508 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	FERMT3	Q86UX7	667 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	RFXAP	O00287	272 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	IL17A	Q16552	155 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	FIBCD1	Q8N539	461 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PMS1-220	ENST00000618056	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.71	■■■□□ 2.03

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