RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 GAP43P17677 238 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RPAINQ86UA6 219 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SERINC5Q86VE9 423 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL13Q8N6R0 699 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SMARCE1Q969G3 411 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RSPH10BP0C881 870 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM143Q96AN5 459 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PANK4Q9NVE7 773 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ASAP2O43150 1006 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RHOBTB3O94955 611 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM13AO94988 1023 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PLS3P13797 630 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 IDEP14735 1019 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 DRP2Q13474 957 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PTGISQ16647 500 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RMND1Q9NWS8 449 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2C9P11712 490 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 CLCN3P51790 818 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX10P56693 466 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 CDC42EP1Q00587 391 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 NME8Q8N427 588 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 TOX2Q96NM4 488 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP7D2Q96T17 732 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 COASYQ13057 564 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PTK7Q13308 1070 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP2R5AQ15172 486 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNN1Q92952 543 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 ABHD8Q96I13 439 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 EVPLQ92817 2033 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 GLRA2P23416 452 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 POU5F1BQ06416 359 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMD2Q13200 908 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 IFT74Q96LB3 600 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 EXOC1Q9NV70 894 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-205ENST00000528462 SFI1A8K8P3 1242 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 B4GALT4O60513 344 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 CD4P01730 458 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 SCP2P22307 547 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 NAMPTP43490 491 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 ODR4Q5SWX8 454 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 MYCT1Q8N699 235 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 FIZ1Q96SL8 496 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 POLD4Q9HCU8 107 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 SFR1Q86XK3 245 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 BSNDQ8WZ55 320 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-205ENST00000528462 NOD1Q9Y239 953 aa24.32■■□□□ 1.48
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