RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 STK24Q9Y6E0 443 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 PDIA5Q14554 519 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.51■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 NACC1Q96RE7 527 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 MTRQ99707 1265 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAM2Q99965 735 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 TMX1Q9H3N1 280 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WZ62 844 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 MED24O75448 989 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.5■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 IGFBP4P22692 258 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 RPA1P27694 616 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 PRPHP41219 470 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 EMC2Q15006 297 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 BRAPQ7Z569 592 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF410Q86VK4 478 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM143Q96AN5 459 aa21.5■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WWV3 80 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01553A4QN01 128 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ASAP2O43150 1006 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 DGAT1O75907 488 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF15O94989 841 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 RGS18Q9NS28 235 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ARID2Q68CP9 1835 aa21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 MUTP22033 750 aa21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 RARRES1P49788 294 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 KSR1Q8IVT5 923 aa21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 SYT1P21579 422 aa21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 KRT79Q5XKE5 535 aa21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 FIBCD1Q8N539 461 aa21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP4-209ENST00000484097 RFXAPO00287 272 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 FGFR4P22455 802 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 POTEGQ6S5H5 508 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 SAMD11Q96NU1 681 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 C9IYK1 514 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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SH3BP4-209ENST00000484097 BMP15O95972 392 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 TFDP1Q14186 410 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 DSC3Q14574 896 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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SH3BP4-209ENST00000484097 DACT1Q9NYF0 836 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRE1Q14246 886 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF149Q8NC42 400 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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SH3BP4-209ENST00000484097 CHST12Q9NRB3 414 aa21.44■■□□□ 1.02
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