RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHST12Q9NRB3 414 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DACT1Q9NYF0 836 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.56□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND3A2RUS2 1198 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WNT7AO00755 349 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DTNBO60941 627 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VTNP04004 478 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CA3P07451 260 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SKIP12755 728 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PBX2P40425 430 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TECP42680 631 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RARRES1P49788 294 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP4A11Q02928 519 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TFDP1Q14186 410 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMC2Q15006 297 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT79Q5XKE5 535 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP7Q8WX94 980 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OSMRQ99650 979 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS18Q9NS28 235 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGL1Q9NZL6 768 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GINS2Q9Y248 185 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.55□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ENPP3O14638 875 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOSL2P15408 326 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AXLP30530 894 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHKA2P46019 1235 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB27AP51159 221 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-21P61565 698 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q7L0L9 218 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM228AQ86W67 206 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC51Q96ER9 411 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GUCD1Q96NT3 240 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIPINQ9BVW5 301 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCND2Q9NZV8 630 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.54□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCOR1O75376 2440 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDH23Q9H251 3354 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC01553A4QN01 128 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9IYK1 514 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STX6O43752 255 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RB1P06400 928 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYT1P21579 422 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCP2P22307 547 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RABGGTBP53611 331 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPEPPSP55786 919 aa9.53□□□□□ -0.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAP1Q03518 808 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms