RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551710.1

CNOT2-233, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 5

Gene CNOT2, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-233	ENST00000551710	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	KRT37	O76014	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	CFHR4	Q92496	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	CYP27B1	O15528	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	MPIG6B	O95866	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	CEP72	Q9P209	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-233	ENST00000551710	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	KCNA6	P17658	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	BMP5	P22003	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	LMO1	P25800	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	AOAH	P28039	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	CD83	Q01151	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ZNF460	Q14592	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	PRRX2	Q99811	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	GJA4	P35212	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	STAT5B	P51692	787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710		Q9UFV3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	SLC26A4	O43511	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ECE1	P42892	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	MOGS	Q13724	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	ACAP1	Q15027	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	STIL	Q15468	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710		A0A1W2PRX2	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710		M0R2C6	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	GSTA4	O15217	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	FOXN1	O15353	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	FOXP2	O15409	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	EFCAB14	O75071	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	STAT3	P40763	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	HERVK_113	P62684	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-233	ENST00000551710	IRF9	Q00978	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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