RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CENPTQ96BT3 561 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 EBF2Q9HAK2 575 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 FGGP02679 453 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 UCHL3P15374 230 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 DAAM2Q86T65 1068 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SPAG5Q96R06 1193 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 NENFQ9UMX5 172 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 RASA1P20936 1047 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ERFEQ4G0M1 354 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 GGT7Q9UJ14 662 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 MMP13P45452 471 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 GOPCQ9HD26 462 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TLDC2A0PJX2 215 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CDC25CP30307 473 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ADAM9Q13443 819 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 COA7Q96BR5 231 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 HES6Q96HZ4 224 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 AZI2Q9H6S1 392 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 E9PMD0 336 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SIK1P57059 783 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 KCNJ2P63252 427 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 GJB7Q6PEY0 223 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 AGAP11Q8TF27 550 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 GLG1Q92896 1179 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ASAP2O43150 1006 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SATB1Q01826 763 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 FBXO41Q8TF61 875 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SNED1Q8TER0 1413 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.167e-11■■■□□ 18.9
PMS1-222ENST00000639501 GNA14O95837 355 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 GSTA1P08263 222 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 IFNAR2P48551 515 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CASP5P51878 434 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ITIH4Q14624 930 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 HOOK2Q96ED9 719 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ANP32DO95626 131 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PON1P27169 355 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PDIA5Q14554 519 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 HOOK3Q86VS8 718 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 NR2F2P24468 414 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 KLRC3Q07444 240 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DUPD1Q68J44 220 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 HAS1Q92839 578 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 NUDT17P0C025 328 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms