RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	ADAM2	Q99965	735 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	TLE6	Q9H808	572 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP36-223	ENST00000592326	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MEIS1	O00470	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	GPR182	O15218	404 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ATG7	O95352	703 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	EFHB	Q8N7U6	833 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PER2	O15055	1255 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CCNE2	O96020	404 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SREBF1	P36956	1147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FBXL18	Q96ME1	805 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	COL1A2	P08123	1366 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MGEA5	O60502	916 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	UBE3A	Q05086	875 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	OSMR	Q99650	979 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	C6orf50	Q9HD87	102 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TLR9	Q9NR96	1032 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FGF18	O76093	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SEC24B	O95487	1268 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	EYA4	O95677	639 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	VTN	P04004	478 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PSAP	P07602	524 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CDC27	P30260	824 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MRE11	P49959	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	COASY	Q13057	564 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	KRT32	Q14532	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	ABI1	Q8IZP0	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	EDA	Q92838	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	SCLT1	Q96NL6	688 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	MAP7D2	Q96T17	732 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	KCNH6	Q9H252	994 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	AKT3	Q9Y243	479 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326		C9IYK1	514 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP36-223	ENST00000592326	C22orf31	O95567	290 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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