RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A17Q9H1V8 727 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL33A6NCF5 533 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT19A8MXV4 375 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 FZD9O00144 591 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 ABLIM1O14639 778 aa10.11□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 MMEP08473 750 aa10.1□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 CPA6Q8N4T0 437 aa10.1□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.1□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 OR14I1A6ND48 311 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF10A6NK89 507 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L22H0YM25 854 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
PTPRC-212ENST00000491302 CLUL1Q15846 466 aa10.09□□□□□ -0.79
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PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 INVSQ9Y283 1065 aa10.08□□□□□ -0.8
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PTPRC-212ENST00000491302 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
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PTPRC-212ENST00000491302 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 ETV3LQ6ZN32 361 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 TTC8Q8TAM2 541 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 DDX11Q96FC9 970 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
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PTPRC-212ENST00000491302 ROM1Q03395 351 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRC-212ENST00000491302 UGT8Q16880 541 aa10.06□□□□□ -0.8
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PTPRC-212ENST00000491302 CAND2O75155 1236 aa10.05□□□□□ -0.8
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