RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 IFNGR1P15260 489 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ENPP1P22413 925 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ALAS2P22557 587 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CTSKP43235 329 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CCDC96Q2M329 555 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PGS1Q32NB8 556 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 COA7Q96BR5 231 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MEGF11A6BM72 1044 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 FAM187AA6NFU0 413 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MEIS1O00470 390 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 LILRB5O75023 590 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PDE6AP16499 860 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MX2P20592 715 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 RRM1P23921 792 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CD40P25942 277 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 HTR1BP28222 390 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SEPHS1P49903 392 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 BLMHQ13867 455 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CCDC38Q502W7 563 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PDXDC1Q6P996 788 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KCNK18Q7Z418 384 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KSR1Q8IVT5 923 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MMP19Q99542 508 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MBIPQ9NS73 344 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.81□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 DLL1O00548 723 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KPNA5O15131 536 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 NCK2O43639 380 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MGEA5O60502 916 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 AMY2AP04746 511 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ALDH2P05091 517 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 AMY2BP19961 511 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KIF11P52732 1056 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 JAM2P57087 298 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ICA1Q05084 483 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MOGSQ13724 837 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 INF2Q27J81 1249 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ILDR2Q71H61 639 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 DYMQ7RTS9 669 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KRT77Q7Z794 578 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PHKBQ93100 1093 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ARL8AQ96BM9 186 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CDIP1Q9H305 208 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CYP4F12Q9HCS2 524 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PADI4Q9UM07 663 aa5.8□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ITIH6Q6UXX5 1313 aa5.79□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CDC14CA4D256 554 aa5.79□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 A6NCN8 305 aa5.79□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.79□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 EYA2O00167 538 aa5.79□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MBD4O95243 580 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms