RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRT83P78385 493 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP55Q53EZ4 464 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCERG1LQ5VWI1 586 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RINT1Q6NUQ1 792 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HINFPQ9BQA5 517 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYO6Q9UM54 1294 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSME4Q14997 1843 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FRMD3A2A2Y4 597 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMD10O75832 226 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOL4O94818 638 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP3A4P08684 503 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EPS15P42566 896 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RASSF7Q02833 373 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMCO3Q6UWJ1 677 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSD17B14Q9BPX1 270 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NFKBIEO00221 500 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRT86O43790 486 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPA17Q15506 151 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM83AQ86UY5 434 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM59Q8IWR1 403 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYCT1Q8N699 235 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF536O15090 1300 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A1W2PQJ5 194 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHF20L1A8MW92 1017 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CETN3O15182 167 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ITGB5P18084 799 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNH2Q12809 1159 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COG2Q14746 738 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FIGNQ5HY92 759 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PNKPQ96T60 521 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM150BA6NC51 233 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TLR2O60603 784 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AKAP3O75969 853 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MOCS3O95396 460 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC9A1P19634 815 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AMPD2Q01433 879 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF5AQ12840 1032 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MTMR2Q13614 643 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WNK4Q96J92 1243 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FEM1BQ9UK73 627 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FLOT1O75955 427 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM13AO94988 1023 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EYA4O95677 639 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDXDC1Q6P996 788 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MICALL2Q8IY33 904 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC170Q8IYT3 715 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEPSINQ96N21 525 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BUB1O43683 1085 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TBC1D12O60347 775 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SASH3O75995 380 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNA2P51530 1060 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCTP2Q6DN12 878 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RABGGTAQ92696 567 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JADE2Q9NQC1 790 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTAGE15A4D2H0 777 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTAGE8P0CG41 777 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRELPP51888 382 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VAV2P52735 878 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTAGE6Q86UF2 777 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM160B2Q86V87 743 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTAGE4Q8IX94 777 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP112Q8N8E3 955 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC5A5Q92911 643 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP63Q96MT8 703 aa13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms