RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCG1P19174 1290 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 VEGFBP49765 207 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 GHRHRQ02643 423 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DGKZQ13574 1117 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP55Q53EZ4 464 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 HS1BP3Q53T59 392 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DLK2Q6UY11 383 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MB21D1Q8N884 522 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC4DQ8WXI8 215 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PLIN2Q99541 437 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM5Q9C035 493 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM86B1E9PN63 330 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP1P13497 986 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 STAT3P40763 770 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 9.4
RABGGTB-201ENST00000319942 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 ELP3Q9H9T3 547 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WWV3 80 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MEIS1O00470 390 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 NFIBO00712 420 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF6O14896 467 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL5Q02045 173 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIL2Q13356 520 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PLS1Q14651 629 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 NSMFQ6X4W1 530 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 STAMQ92783 540 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF146Q9NTX7 359 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SBF1O95248 1867 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MSH4O15457 936 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP1BP68106 108 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 GRB10Q13322 594 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 STIM1Q13586 685 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 CUL4BQ13620 913 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNB1Q14721 858 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 HYIQ5T013 277 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SARM1Q6SZW1 724 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST13Q8NET6 341 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO40Q9UH90 709 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 MAFGO15525 162 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 TPM3P06753 285 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 BCRP11274 1271 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP6P22004 513 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R2P41236 205 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms