RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CEP44Q9C0F1 390 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 GREM1O60565 184 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CRKP46108 304 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KCNQ1P51787 676 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 GTF2A2P52657 109 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 IGBP1P78318 339 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 LRP8Q14114 963 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DACT2Q5SW24 774 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 EYA3Q99504 573 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 AOX1Q06278 1338 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 METTL12A8MUP2 240 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 HMOX1P09601 288 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 GRIA4P48058 902 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 FLT3LGP49771 235 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 LMNB2Q03252 620 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TFF2Q03403 129 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PANK3Q9H999 370 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PPT2Q9UMR5 302 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 BTBD11A6QL63 1104 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 FSTP19883 344 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SEZ6Q53EL9 994 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SOX13Q9UN79 622 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.73□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 RAB11FIP3O75154 756 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PPP2R1AP30153 589 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 CHMP4BP1P59074 171 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SLFN5Q08AF3 891 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 VGLL4Q14135 290 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 BECN1Q14457 450 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 RASA3Q14644 834 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 KCNB2Q92953 911 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 WNT8BQ93098 351 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 RNF112Q9ULX5 631 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 LTBP2Q14767 1821 aa9.72□□□□□ -0.85
LMO3-216ENST00000537568 PRR33A8MZF0 331 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ENPP3O14638 875 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ENC1O14682 589 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 MCM4P33991 863 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 PARP10Q53GL7 1025 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ANKS1AQ92625 1134 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 SHDQ96IW2 340 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 CRBNQ96SW2 442 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 CEP41Q9BYV8 373 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 CD320Q9NPF0 282 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 RAXQ9Y2V3 346 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 MYO9BQ13459 2157 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 TRIOO75962 3097 aa9.71□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 PAGE1O75459 146 aa9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 UFL1O94874 794 aa9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 NLRP12P59046 1061 aa9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 ANAPC15P60006 121 aa9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 HGSNATQ68CP4 663 aa9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.7□□□□□ -0.86
LMO3-216ENST00000537568 FBXO27Q8NI29 283 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms