RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ10AQ96MF6 247 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 HINFPQ9BQA5 517 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP26Q9BV47 211 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYBUQ9NX95 663 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLA2G3Q9NZ20 509 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPEF2O14830 753 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHACTR2O75167 634 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRN2O75325 713 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYPP08247 313 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A13PP0C7W8 464 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A24PP0C7X0 464 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBLP22681 906 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSF2RBP32927 897 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR4A2P43354 598 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGS3P49796 1198 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC24CP53992 1094 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CORO7P57737 925 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 PROK1P58294 105 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF626Q68DY1 528 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD300LDQ6UXZ3 194 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZUG5 572 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT77Q7Z794 578 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF25Q86VW2 580 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG16Q8N0X2 631 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAGLBQ8NCG7 672 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSMCE1Q8WV22 266 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00476Q8WZB0 136 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC9A6Q92581 669 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELMO3Q96BJ8 720 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCTN2Q96GX1 697 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 AJUBAQ96IF1 538 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLIC6Q96NY7 704 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 WRNIP1Q96S55 665 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPYSL5Q9BPU6 564 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 WNT10AQ9GZT5 417 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM260Q9NX78 707 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTBD3Q9Y2F9 522 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFITM10A6NMD0 228 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM20BO75063 409 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARNTP27540 789 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX11P35716 441 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP2R3AQ06190 1150 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FKBP15Q5T1M5 1219 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MORN5Q5VZ52 161 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRAPQ7Z569 592 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CABP7Q86V35 215 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIB1Q86YT6 1006 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SULF2Q8IWU5 870 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 REXO1L1PQ8IX06 675 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM26EQ8N5C1 309 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 NETO2Q8NC67 525 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 DENND1AQ8TEH3 1009 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX29Q8TEQ0 813 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCE3DQ9BYE3 92 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 RXFP1Q9HBX9 757 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A10PA6NDY2 464 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF10BO14763 440 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOCS5O75159 536 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL18O94889 574 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALPLP05186 524 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TACR1P25103 407 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 WEE1P30291 646 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAN2A2P49641 1150 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 VEGFCP49767 419 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCNN1GP51170 649 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 ETF1P62495 437 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIGD2Q4W5G0 525 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC62Q6P9F0 684 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-172P-201ENST00000411000 BARGINQ6ZT62 677 aa0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms