RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 DBN1Q16643 649 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 INHBAP08476 426 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 RASSF2P50749 326 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC7A5Q01650 507 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC35F6Q8N357 371 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 LCORLQ8N3X6 602 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZWILCHQ9H900 591 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PFKFB2O60825 505 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PTK2Q05397 1052 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 IWS1Q96ST2 819 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TUBB2AQ13885 445 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 GBP5Q96PP8 586 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 BAG5Q9UL15 447 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF394Q53GI3 561 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ELMOD1Q8N336 334 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 LRGUKQ96M69 825 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ANO4Q32M45 955 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 KCTD6Q8NC69 237 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 KRT1P04264 644 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 IQCB1Q15051 598 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SERPINB2P05120 415 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 H2AFZP0C0S5 128 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PPP2R5BQ15173 497 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 H2AFVQ71UI9 128 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 AIFM3Q96NN9 605 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 HACD3Q9P035 362 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TBX22Q9Y458 520 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 KIF11P52732 1056 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 MFAP3P55082 362 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 FGD4Q96M96 766 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D12O60347 775 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF445P59923 1031 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 NT5C1BQ96P26 610 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TOM1L1O75674 476 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 BRD1O95696 1058 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX19P40855 299 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PLTPP55058 493 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 GNGT2O14610 69 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZSCAN26Q16670 478 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SZRD1Q7Z422 152 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 MYO1FO00160 1098 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 TTLL1O95922 423 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ARHGAP25P42331 645 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 AFF2P51816 1311 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM196BA6NMK8 535 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 GPC4O75487 556 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 METTL23Q86XA0 190 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4-201ENST00000375023 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4-201ENST00000375023 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4-201ENST00000375023 CPP00450 1065 aa15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4-201ENST00000375023 CCT5P48643 541 aa15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4-201ENST00000375023 ARHGAP4P98171 946 aa15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4-201ENST00000375023 ASPHQ12797 758 aa15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4-201ENST00000375023 TFDP1Q14186 410 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms