RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PRG0 241 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 F5H6K3 240 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 KLRC3Q07444 240 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 MTRQ99707 1265 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 MB21D1Q8N884 522 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 DNAJC7Q99615 494 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 GDAQ9Y2T3 454 aa22.43■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 LGALS16A8MUM7 142 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 ECE1P42892 770 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 KRT83P78385 493 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 KIAA1328Q86T90 577 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PQC6 194 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PPFIA4O75335 1185 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PRCPP42785 496 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 HERVK_113P62684 666 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 STIM1Q13586 685 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 TMEM260Q9NX78 707 aa22.42■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 TRAPPC10P48553 1259 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 IL17AQ16552 155 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 GALNT17Q6IS24 598 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 COG1Q8WTW3 980 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 C6orf50Q9HD87 102 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 CAGE1Q8TC20 777 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.41■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 KRT86O43790 486 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 SRGAP2O75044 1071 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 GNA11P29992 359 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 SNAP25P60880 206 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 MICALL2Q8IY33 904 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 NDUFB10O96000 172 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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VGF-201ENST00000249330 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 ACER1Q8TDN7 264 aa22.4■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 FZD9O00144 591 aa22.39■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 RASA3Q14644 834 aa22.39■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.39■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.39■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.39■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.39■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 ADSSL1Q8N142 457 aa22.39■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 ZBTB5O15062 677 aa22.38■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 WDR59Q6PJI9 974 aa22.38■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.38■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 TFR2Q9UP52 801 aa22.38■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 THAP9Q9H5L6 903 aa22.38■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.37■■□□□ 1.17
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VGF-201ENST00000249330 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 DCAF4Q8WV16 495 aa22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 TRIM47Q96LD4 638 aa22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.37■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 GGCXP38435 758 aa22.36■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 MEA1Q16626 185 aa22.36■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 UBE2SQ16763 222 aa22.36■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.36■■□□□ 1.17
VGF-201ENST00000249330 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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