RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 C1orf159Q96HA4 380 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 GJD2Q9UKL4 321 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 HCN2Q9UL51 889 aa6.56□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 A0A087WV62 115 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 AKAP5P24588 427 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAD52P43351 418 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRKG2Q13237 762 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP135Q66GS9 1140 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SNX32Q86XE0 403 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CERS4Q9HA82 394 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 LCHNA4D1U4 455 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMCC2O75069 709 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 POU2F2P09086 479 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPIAP49247 311 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 HDXQ7Z353 690 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 C12orf40Q86WS4 652 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.55□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TISP43B9A030 160 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 B9A039 149 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TGM5O43548 720 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TUSC2O75896 110 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TIMP2P16035 220 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SIK1P57059 783 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM193AP78312 1265 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 BTKQ06187 659 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDE4BQ07343 736 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 BHMTQ93088 406 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 HVCN1Q96D96 273 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SOX13Q9UN79 622 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 A0A0G2JS52 829 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 BAIAP3O94812 1187 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEPT2Q15019 361 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 GGT6Q6P531 493 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM13CQ8NE31 585 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 DDX11Q96FC9 970 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.54□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TOR1BO14657 336 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 KRT20P35900 424 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 STYK1Q6J9G0 422 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCT2Q8NC54 265 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CABP5Q9NP86 173 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM227AF5H4B4 570 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SHOXO15266 292 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPM1BO75688 479 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 MTA2O94776 668 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 CKMP06732 381 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSPAN7P41732 249 aa6.53□□□□□ -1.36
CSNK1G3-210ENST00000521364 ECI1P42126 302 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms