RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 TBX3O15119 743 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 JDP2Q8WYK2 163 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF592Q92610 1267 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 SH2D4AQ9H788 454 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 MFAP3LO75121 409 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 POLD1P28340 1107 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ZSCAN12O43309 604 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 PLA2G6O60733 806 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 NFKBIEO00221 500 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 GYPCP04921 128 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CIITAP33076 1130 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 KIF18AQ8NI77 898 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC51Q96ER9 411 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 MTFR1LQ9H019 292 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM14Q14142 442 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 TNIP1Q15025 636 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 DYMQ7RTS9 669 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CNGA4Q8IV77 575 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 LENG9Q96B70 501 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 LGALS16A8MUM7 142 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 EHHADHQ08426 723 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 PRR16Q569H4 304 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 DDX12PQ92771 950 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 SHTN1A0MZ66 631 aa25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CYP3A4P08684 503 aa25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 FAM160B2Q86V87 743 aa25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 HPS3Q969F9 1004 aa25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ASNSP08243 561 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 TPM1P09493 284 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 FECHP22830 423 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CASP14P31944 242 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CENPPQ6IPU0 288 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 PSMD2Q13200 908 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PQC6 194 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FAM86B1E9PN63 330 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 UBXN1Q04323 297 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FAM20AQ96MK3 541 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 MB21D1Q8N884 522 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FEM1BQ9UK73 627 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 POTEB3A0JP26 581 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 POTECB2RU33 542 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 STAT3P40763 770 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 RASA3Q14644 834 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 POTEBQ6S5H4 581 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 KIFC2Q96AC6 838 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 IDEP14735 1019 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 UIMC1Q96RL1 719 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 TNFAIP1Q13829 316 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC174Q6PII3 467 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 TSC1Q92574 1164 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 STK24Q9Y6E0 443 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 E9PMD0 336 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 MED24O75448 989 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ERMNQ8TAM6 284 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 TEPSINQ96N21 525 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.48■■□□□ 1.67
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