RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-201	ENST00000262291	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEB3	A0JP26	581 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEC	B2RU33	542 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291		E9PMD0	336 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	FAM86B1	E9PN63	330 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	N4BP3	O15049	544 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	LRRC41	Q15345	812 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEB	Q6S5H4	581 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TMX1	Q9H3N1	280 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	MEIS1	O00470	390 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	RHOBTB3	O94955	611 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	RBL2	Q08999	1139 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TC2N	Q8N9U0	490 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	GOPC	Q9HD26	462 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		15.19	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CCDC66	A2RUB6	948 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	MTF1	Q14872	753 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PTPN14	Q15678	1187 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	KIF18A	Q8NI77	898 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	RAD54L	Q92698	747 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	RAB34	Q9BZG1	259 aa		15.18	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	INPP5B	P32019	993 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	KCNB1	Q14721	858 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	DDX12P	Q92771	950 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	DESI2	Q9BSY9	194 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	VCPKMT	Q9H867	229 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEF	A5A3E0	1075 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEI	P0CG38	1075 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF76	P36508	570 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEG	Q6S5H5	508 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM139	Q8IV31	216 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PSMA7	O14818	248 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	MED24	O75448	989 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CYP4A11	Q02928	519 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CPXCR1	Q8N123	301 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CASP14	P31944	242 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PDIA5	Q14554	519 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TNIP1	Q15025	636 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	FAM83A	Q86UY5	434 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CUEDC2	Q9H467	287 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	HACL1	Q9UJ83	578 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PSMC6	P62333	389 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	AMPD3	Q01432	767 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	STIM1	Q13586	685 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TTI2	Q6NXR4	508 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	DLK2	Q6UY11	383 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	LENG9	Q96B70	501 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	TEPSIN	Q96N21	525 aa		15.16	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	CHMP2A	O43633	222 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	USP11	P51784	963 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	UBXN1	Q04323	297 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	NRDC	O43847	1150 aa		15.15	■□□□□ 0.02
VMP1-201	ENST00000262291	PRKG1	Q13976	671 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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