RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 STK4Q13043 487 aa23.54■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.54■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 RMND1Q9NWS8 449 aa23.54■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 UBXN2AP68543 259 aa23.53■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 NR1I3Q14994 352 aa23.53■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 CFBP00751 764 aa23.53■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP4P98171 946 aa23.53■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PDE4DQ08499 809 aa23.53■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 TNIP1Q15025 636 aa23.53■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.52■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.52■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 FAM86B1E9PN63 330 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.52■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 ADSSL1Q8N142 457 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 TEPSINQ96N21 525 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 VPS16Q9H269 839 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.51■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.51■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 FEZ1Q99689 392 aa23.51■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 SV2BQ7L1I2 683 aa23.5■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 TSC1Q92574 1164 aa23.5■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 A0A1B0GTH6 734 aa23.5■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 KRT31Q15323 416 aa23.49■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 TNNT1P13805 278 aa23.48■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 POTEBQ6S5H4 581 aa23.48■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC125Q86Z20 511 aa23.48■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 RAD54LQ92698 747 aa23.47■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 KCNJ18B7U540 433 aa23.47■■□□□ 1.35
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PRDM4-205ENST00000550376 KCNJ12Q14500 433 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 LENG9Q96B70 501 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 N4BP3O15049 544 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM4-205ENST00000550376 AP3B2Q13367 1082 aa23.46■■□□□ 1.35
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