RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 NEFMP07197 916 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 SCRIBQ14160 1630 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 FBXW7Q969H0 707 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 WDR70Q9NW82 654 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.47□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 TMTC2Q8N394 836 aa9.46□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 IL27Q8NEV9 243 aa9.46□□□□□ -0.89
RRN3-202ENST00000327307 BRD1O95696 1058 aa9.46□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 IRF5Q13568 498 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 SPATA32Q96LK8 384 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 BARGINQ6ZT62 677 aa9.43□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 RETREG2Q8NC44 543 aa9.43□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.43□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.43□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 P3H3Q8IVL6 736 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 SGSM3Q96HU1 749 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RRN3-202ENST00000327307 TRAK2O60296 914 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 MARCH6O60337 910 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 FAM193AP78312 1265 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.38□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.37□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 PHF14O94880 888 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 PPME1Q9Y570 386 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 GORABQ5T7V8 394 aa9.35□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 UNCXA6NJT0 531 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 FLIIQ13045 1269 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-202ENST00000327307 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD62A6NC57 917 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 A6NJR5 290 aa9.31□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 SPOCK2Q92563 424 aa9.31□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.31□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 CLGNO14967 610 aa9.3□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.29□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.29□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 29.6
RRN3-202ENST00000327307 RALBP1Q15311 655 aa9.27□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 PROM2Q8N271 834 aa9.27□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 NME8Q8N427 588 aa9.27□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.27□□□□□ -0.92
RRN3-202ENST00000327307 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 SLC4A2P04920 1241 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 SIRT1Q96EB6 747 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 ZMYND10O75800 440 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 ERCC3P19447 782 aa9.24□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 DRC1Q96MC2 740 aa9.24□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.24□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 NCAPD3P42695 1498 aa9.23□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 RINLQ6ZS11 566 aa9.22□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.21□□□□□ -0.93
RRN3-202ENST00000327307 CUX2O14529 1486 aa9.21□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms