RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ANO3Q9BYT9 981 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 HERVK_113P62684 666 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF174Q15697 407 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CCL15Q16663 113 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 TKFCQ3LXA3 575 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 PNMA3Q9UL41 463 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 GPT2Q8TD30 523 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 NFIBO00712 420 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 MCM7P33993 719 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 STAT3P40763 770 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 HSD17B4P51659 736 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ADALQ6DHV7 355 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 RNF146Q9NTX7 359 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 LETM2Q2VYF4 491 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 RGMBQ6NW40 437 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 TBC1D5Q92609 795 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 MAF1Q9H063 256 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PQ27 194 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PQ64 194 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PQD8 194 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 PTGDRQ13258 359 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 RIPK3Q9Y572 518 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 BTBD19C9JJ37 291 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 SREBF1P36956 1147 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 USP11P51784 963 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 PLS1Q14651 629 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 BTBD7Q9P203 1132 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 LAD1O00515 517 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CUTAO60888 179 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 PTPREP23469 700 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 FSTL1Q12841 308 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 PDHXO00330 501 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 EDIL3O43854 480 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGAP4P98171 946 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 FERMT2Q96AC1 680 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 ACAD9Q9H845 621 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 NEMFO60524 1076 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 SLC10A3P09131 477 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 CHST13Q8NET6 341 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 CNMDO75829 334 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 YY1P25490 414 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO40Q9UH90 709 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 CYP3A4P08684 503 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 COPB2P35606 906 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 PRPHP41219 470 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 NSMFQ6X4W1 530 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC71-201ENST00000321895 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms