RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581467.1

TIMM21-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 21, human

TSL 2

Gene TIMM21, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM21-205	ENST00000581467	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	PTPRE	P23469	700 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	CMA1	P23946	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	INPP5B	P32019	993 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	NF2	P35240	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	USP14	P54578	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	ZNF174	Q15697	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	LPAR1	Q92633	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	CUL5	Q93034	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM21-205	ENST00000581467		A0A1B0GVL5	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	LAD1	O00515	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PLA2G6	O60733	806 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PFKFB1	P16118	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PTPRA	P18433	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	MCM7	P33993	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	EPHX2	P34913	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	SYK	P43405	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	MRE11	P49959	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	NDUFA8	P51970	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	SNAP25	P60880	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PTGDR	Q13258	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	INF2	Q27J81	1249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM21-205	ENST00000581467	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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