RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 ZNF536O15090 1300 aa25.31■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.3■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 TNFRSF25Q93038 417 aa25.3■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.3■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 REPS2Q8NFH8 660 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 HERVK_113P62684 666 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.28■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 PIK3CDO00329 1044 aa25.27■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 PTMSP20962 102 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-202ENST00000525194 AP3B2Q13367 1082 aa25.27■■□□□ 1.64
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ACER3-202ENST00000525194 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.26■■□□□ 1.63
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ACER3-202ENST00000525194 PDHXO00330 501 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 STAT3P40763 770 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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ACER3-202ENST00000525194 MCM4P33991 863 aa25.25■■□□□ 1.63
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ACER3-202ENST00000525194 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 PLS1Q14651 629 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 CREBZFQ9NS37 354 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 MEIS2O14770 477 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 CFBP00751 764 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 APLP1P51693 650 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 SREBF2Q12772 1141 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 UBE2SQ16763 222 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 ANO1Q5XXA6 986 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 CHST13Q8NET6 341 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 SPATA32Q96LK8 384 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 USP28Q96RU2 1077 aa25.23■■□□□ 1.63
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ACER3-202ENST00000525194 RNF146Q9NTX7 359 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 FBXO40Q9UH90 709 aa25.23■■□□□ 1.63
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ACER3-202ENST00000525194 YEATS4O95619 227 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 BMP15O95972 392 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 GHRHRQ02643 423 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 TMEM260Q9NX78 707 aa25.22■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 ADAMTS3O15072 1205 aa25.21■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 FIBPO43427 364 aa25.21■■□□□ 1.63
ACER3-202ENST00000525194 SLC25A27O95847 323 aa25.21■■□□□ 1.63
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