RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.06■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 BACH1O14867 736 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 RNF8O76064 485 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SLMAPQ14BN4 828 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 PRR16Q569H4 304 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 RASSF10A6NK89 507 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ESYT3A0FGR9 886 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 DIAPH2O60879 1101 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 KIFAP3Q92845 792 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 PHEXP78562 749 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 GGT7Q9UJ14 662 aa16.05■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MFAP3LO75121 409 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ZWINTO95229 277 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 GNA11P29992 359 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 LLGL1Q15334 1064 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 LTKP29376 864 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MAP4K1Q92918 833 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 TRPC3Q13507 836 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 METP08581 1390 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 GEN1Q17RS7 908 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 APPBP2Q92624 585 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ECT2Q9H8V3 914 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 THEGQ9P2T0 379 aa16.04■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 GCP02774 474 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 GNAT2P19087 354 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 RAD23BP54727 409 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 USP37Q86T82 979 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 LCA5Q86VQ0 697 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 IFNB1P01574 187 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 LGR6Q9HBX8 967 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MTF1Q14872 753 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 USP44Q9H0E7 712 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 TMED2Q15363 201 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 COG1Q8WTW3 980 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SEPT2Q15019 361 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.03■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 RASA3Q14644 834 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 IP6K1Q92551 441 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 WDR91A4D1P6 747 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 P3H4Q92791 437 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 BAG3O95817 575 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 PALM2Q8IXS6 379 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 SSH3Q8TE77 659 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.02■□□□□ 0.16
PCNX1-202ENST00000439984 CNGA1P29973 690 aa16.02■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 USP14P54578 494 aa16.02■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.02■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 GMNNO75496 209 aa16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 IQCDQ96DY2 449 aa16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.159e-8■□□□□ 9.3
PCNX1-202ENST00000439984 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 MADDQ8WXG6 1647 aa16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PCNX1-202ENST00000439984 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms