RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-208ENST00000540606 MAP4K1Q92918 833 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SNAP23O00161 211 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 TMOD1P28289 359 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ELF2Q15723 593 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 COX16Q9P0S2 106 aa14.61□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 USP17L8P0C7I0 530 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 NDUFA8P51970 172 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 LCORLQ8N3X6 602 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 DDAH1O94760 285 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 CMA1P23946 247 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 TNNC2P02585 160 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 HESX1Q9UBX0 185 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.6□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 PSMD6Q15008 389 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 COA7Q96BR5 231 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 BUB1O43683 1085 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 GMNNO75496 209 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 GNA14O95837 355 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ZNF445P59923 1031 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ADCY9O60503 1353 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 NDUFAB1O14561 156 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 TTLL1O95922 423 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 MED23Q9ULK4 1368 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 TBC1D8O95759 1140 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 GBP6Q6ZN66 633 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 KSR1Q8IVT5 923 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 NBPF3Q9H094 633 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 AMFRQ9UKV5 643 aa14.59□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 M0R2C6 588 aa14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 CACNB3P54284 484 aa14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 VPS52Q8N1B4 723 aa14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 OSBP2Q969R2 916 aa14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 HINFPQ9BQA5 517 aa14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ATE1-208ENST00000540606 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 KCNK3O14649 394 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 CIAO1O76071 339 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 ATP5DP30049 168 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 PIGSQ96S52 555 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 SUSD4Q5VX71 490 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 MCTP2Q6DN12 878 aa14.58□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.57□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 NR5A1Q13285 461 aa14.57□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 LRRC41Q15345 812 aa14.57□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATE1-208ENST00000540606 SPATA24Q86W54 205 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms