RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 KIR3DS1Q14943 382 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 NCAPHQ15003 741 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 NR0B2Q15466 257 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 LCE4AQ5TA78 99 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 PSPNO60542 156 aa6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 RBL2Q08999 1139 aa6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 RAB33AQ14088 237 aa6.05□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 TCEAL1Q15170 157 aa6.05□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 FAM168AQ92567 244 aa6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.05□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 RNF32Q9H0A6 362 aa6.05□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.05□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 VAMP4O75379 141 aa6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 AFMP43652 599 aa6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 GALK1P51570 392 aa6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 DDR2Q16832 855 aa6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.04□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 MYLIPQ8WY64 445 aa6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 KIRREL1Q96J84 757 aa6.04□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.04□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 SMARCA2P51531 1590 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 AURKAO14965 403 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 SUSD5O60279 629 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 FXNQ16595 210 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 NLRX1Q86UT6 975 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 KCNK12Q9HB15 430 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.03□□□□□ -1.44
CLVS1-209ENST00000522928 NCAPD3P42695 1498 aa6.02□□□□□ -1.44
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CLVS1-209ENST00000522928 PPM1BO75688 479 aa6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 ITGAVP06756 1048 aa6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 GLI1P08151 1106 aa6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 GSTM1P09488 218 aa6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.02□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 GBP3Q9H0R5 595 aa6.02□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.02□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 STXBP3O00186 592 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 NRDCO43847 1150 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 DDAH1O94760 285 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 CD3EP07766 207 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 MESP2Q0VG99 397 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP4Q13115 394 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 GRB10Q13322 594 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.01□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.01□□□□□ -1.45
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CLVS1-209ENST00000522928 COPS5Q92905 334 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 ASIC4Q96FT7 647 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 AKT3Q9Y243 479 aa6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 KCNH1O95259 989 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 MSL3P1P0C860 447 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 ATP2B1P20020 1258 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 GRIA2P42262 883 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM67Q5HYA8 995 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 MBLAC2Q68D91 279 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 OGFOD2Q6N063 350 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 OXR1Q8N573 874 aa6□□□□□ -1.45
CLVS1-209ENST00000522928 PTCHD1Q96NR3 888 aa6□□□□□ -1.45
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