RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 Q3C1V9 767 aa23.54■■□□□ 1.36
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ATG4D-208ENST00000588667 ZNF543Q08ER8 600 aa23.53■■□□□ 1.36
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ATG4D-208ENST00000588667 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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ATG4D-208ENST00000588667 MCM2P49736 904 aa23.46■■□□□ 1.35
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ATG4D-208ENST00000588667 GRM4Q14833 912 aa23.46■■□□□ 1.35
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ATG4D-208ENST00000588667 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.45■■□□□ 1.34
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ATG4D-208ENST00000588667 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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ATG4D-208ENST00000588667 GABRQQ9UN88 632 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.44■■□□□ 1.34
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