RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF543Q08ER8 600 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 Q3C1V9 767 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM87BQ96K49 555 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PORCNQ9H237 461 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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RABGGTA-208ENST00000558954 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 REPS2Q8NFH8 660 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 USP26Q9BXU7 913 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBED4O75132 1171 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 COPB2P35606 906 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKCZQ05513 592 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR78Q5VTH9 848 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 OAZ1P54368 228 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR142Q7Z601 462 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 TMTC2Q8N394 836 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 LY9Q9HBG7 655 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP2A1O14983 1001 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC25A27O95847 323 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 STAT3P40763 770 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 RAET1EQ8TD07 263 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 MROH8Q9H579 483 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 ERCC3P19447 782 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMA5P28066 241 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC16A2P36021 539 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 LIFRP42702 1097 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 FLT3LGP49771 235 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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RABGGTA-208ENST00000558954 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SENP2Q9HC62 589 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 GABRQQ9UN88 632 aa22.05■■□□□ 1.12
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RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 IRF5Q13568 498 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 CPXCR1Q8N123 301 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 ABHD8Q96I13 439 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.04■■□□□ 1.12
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RABGGTA-208ENST00000558954 DDAH1O94760 285 aa22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTA-208ENST00000558954 GRM4Q14833 912 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 C8orf34Q49A92 452 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTA-208ENST00000558954 LCTP09848 1927 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 STRNO43815 780 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 GRB14Q14449 540 aa22.02■■□□□ 1.12
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RABGGTA-208ENST00000558954 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 GJD2Q9UKL4 321 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPFP49454 3210 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPREP23469 700 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS2P41220 211 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 FGD1P98174 961 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC174Q6PII3 467 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K14Q99558 947 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 APBA2Q99767 749 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 PNMA2Q9UL42 364 aa22.01■■□□□ 1.11
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